5.3.2 Foldit

Faʻasalaga o se polotini folifi e folifi ai e mafai ai e tagata lē faʻapitoa ona auai i se auala e malie ai.

O le Netflix Prize, e ui o le evocative ma manino, e leʻo faʻamalamalamaina le tele o le tele o galuega tatala. Mo se faʻataʻitaʻiga, i le Netflix Prize le toʻatele o tagata na auai i le tele o tausaga aʻoga i le fuainumera ma le aʻoaʻoina o masini. Ae, o le tatalaina o poloketi telefoni feaveaʻi e mafai ona aofia ai tagata auai e leai ni aʻoaʻoga aloaia, e pei ona faʻataʻitaʻiina e le Foldit, se polotini puʻupuʻu.

O le lafoaia o le Protein o le faagasologa lea e faʻaaogaina ai se filifili o le amino acids. Faatasi ai ma se malamalamaaga sili atu i lenei faagasologa, e mafai e tagata suʻesuʻe o meaola ninii ona mamanuina ni protein i ni foliga patino e mafai ona faʻaaoga e avea ma vailaau. I le faafaigofieina o sina mea itiiti, o mea e puipuia e masani ona agai atu i lo latou tulaga sili ona maualalo-malosi, o se faatulagaga lea e faapaleniina pisa eseese ma toso i totonu o le polotini (fua 5.7). O le mea lea, afai o se tagata suʻesuʻe e manaʻo e faʻataʻitaʻi le foliga o le a gagala ai le protein, e faigofie ona tali le tali: taumafai i faʻataʻitaʻiga uma, faʻatusatusa o latou malosi, ma vavalo o le polotini o le a gagau i le sili ona maualalo o le malosi. O le mea e leaga ai, o le taumafai i faʻatautaia uma e le mafai ona le aoga aua e i ai piliona ma piliona o faʻatonuga talafeagai. E oo lava i komepiuta sili ona mamana o loʻo avanoa i le taimi nei-ma i luma o le malosi o le lumanaʻi o le lumanaʻi o le a le toe galue. O le mea lea, o atinaʻe o loʻo atinaʻeina le tele o algorithms atamai e saili lelei mo le faʻalauteleina o le malosi. Peitai, e ui lava i le tele o aofaʻiga o suʻesuʻega faasaienisi ma faʻatautaia, o nei algorithms e mamao lava mai le atoatoa.

Ata 5.7: Faʻasologa o le Protein. Faʻafanua mai le DrKjaergaard / Wikimedia Commons.

Ata 5.7: Faʻasologa o le Protein. Faʻafanua mai le "DrKjaergaard" / Wikimedia Commons .

O David Baker ma lana vaega suesue i le Iunivesite o Uosigitone o se vaega o le nuu o saienitisi o loo galulue e fatuina ni auala faatautaia i le folifi. I se tasi o poloketi, na fausia ai e Baker ma ana uo se faiga e mafai ai e tagata volenitia ona foai le taimi e le faʻaaogaina ai a latou komepiuta e fesoasoani ai i le faʻataʻitaʻiina o le folifi. I le tali atu, e mafai e tagata volenitia ona matamata i se pusa matala e faʻaalia ai le folifi palatini lea na tupu i la latou komepiuta. O nisi o nei volenitia na tusi atu ia Baker ma ana uo e faapea latou te manatu e mafai ona latou alualu i luma i le faatinoga o le komepiuta pe afai e mafai ona latou aafia i le fuafuaina. Ma o lea na amata ai Foldit (Hand 2010) .

Fetuunaiga e suia le faagasologa o polotini i le taʻavale e mafai ona taina e se tasi. Mai le vaaiga a le tagata taalo, Faʻamatalaga o le a avea ma paso (ata 5.8). O tagata taʻaalo e tuʻuina atu i ai le tolu-dimensional tangle o le fausaga o le porotini ma e mafai ona faia taʻaloga- "tweak," "wiggle," "toe fausia" -e suia ai lona foliga. O le faʻatinoga o nei gaioiga, e sui ai foliga o le polotini, lea e faʻateleina pe faʻaititia ai le sikoa. Faʻataʻitino, o le togi o loʻo fuafua e faʻavae i luga o le malosiaga o le faatulagaga o loʻo i ai nei; o faʻamautuga maualalo maualalo e mafua ai le maualuga o togi. I se isi faaupuga, o le togi e fesoasoani e taʻitaʻia le au taaalo ao latou suʻeina ni faʻalapotopotoga eletise. O lenei taʻavale e mafai ona mafai ona-pei lava o le vavalo o faʻatagaga tifaga i le Netflix Prize-protein folding is also a situation where it is easier to check solutions than generate them.

Ata 5.8: Mataʻalo Taaloga mo Foldit. Faʻataʻitaʻiina e ala ile faatagaga mai le http://www.fold.it.

Ata 5.8: Mataʻalo Taaloga mo Foldit. Faʻataʻitaʻiina e ala ile faatagaga mai le http://www.fold.it.

O le fausaga matagofie o le pusa e mafai ai e le au taaalo ona maua se malamalama aloaia o le biochemistry e tauva ai ma sili atu algorithms ua mamanuina e tagata atamamai. E ui o le toatele o tagata taaalo e le faapitoa le lelei i le galuega, ae o loo i ai ni nai taaalo taʻitoʻatasi ma ni vaega laiti o taaalo e tulaga ese. O le mea moni, i le tauvaga ulu i le va o tagata Foldit players ma le setete o-algorithms, na faia e le au taaalo ni fofo lelei mo le 5 out of 10 proteins (Cooper et al. 2010) .

Foldit ma le Netflix taui e eseese i le tele o auala, ae e aofia uma ai avanoa tatala mo fofo e faigofie ona siaki nai lo le gaosia. I le taimi nei, o le a matou vaaia le faatulagaga tutusa i se isi tulaga ese ese: tulafono pateni. O lenei faʻataʻitaʻiga mulimuli o se faʻalauiloa telefoni feaveaʻi o loʻo faʻaalia ai o lenei auala e mafai foi ona faʻaaoga i tulaga ia e le o manino le mafai ona faʻataunuʻu.