5.3.2 Foldit

فولډیټ یو پروټینینګ لوبه ده چې غیر متخصصین په داسې طریقه کې برخه اخلي چې برخه اخلي.

د نال فلکس انعام، پداسې حال کې چې تشخیص او واضح دی، د ازاد کال د پروژو بشپړه لړۍ نده روښانه کوي. د مثال په توګه، د نال فلکس انعام په ډیری برخه اخیستونکو کې د شمیرو او ماشین زده کړې کې کلونو روزنه درلوده. مګر، د پرانيستې کلي پروژې کې ګډون کونکي هم شامل دي چې رسمي رسمي روزنه نلري، لکه څنګه چې د فولډیت لخوا د پروټین-ټیم لوبه ښودل شوې وه.

د پروټین ډیزاین هغه پروسه ده چې له مخې یې د امینو اسیدونو لړۍ د هغې بڼه ته رسیږي. د دې پروسې د ښه پوهېدو سره، بیولوژیکان کولی شي پروټینونه د ځانګړو شکلونو سره ډیزاین کړي چې کیدای شي د درملو په توګه وکارول شي. په ساده توګه ساده، پروټینونه د دوی ترټولو ټیټ انرژی کنټرول ته لیږدول کیږي، یو ترتیب دی چې مختلف فشارونه توپیر کوي او پروټین کې راځي) 5.7 شکل (. نو، که چیرې یو څیړونکي وغواړي د هغه شکل اټکل وکړي چې پروټین به راولي، حل حل ساده ښکاري: یوازې د ټولو ممکنه ترتیبونو هڅه وکړئ، د دوی انرژي محاسبه کړي، او اټکل کوي چې پروټین به د ټیټه انرژۍ کنټرول کې ضبط شي. له بده مرغه، د ټولو ممکنه ترتیبونو هڅه کول په کمپیوټري ډول ناممکن دي ځکه چې په میلیاردونو او میلیاردونو احتمالي ترتیبات شتون لري. حتی د هغو خورا پیاوړی کمپیوټرونو سره چې نن ورځ شتون لري او د راتلونکی راتلونکی کې - بریښنا ځواک یوازې د کار کولو لپاره نه دی. نو له همدې امله، ژونپوهنه ډیری چټک الګوریتمونه رامنځته کړي چې په اغیزناکه توګه د ټیټ انرژي کنټرول په لټه کې وي. مګر، د ډیرو پیسو علمي او محاسبې هڅې سره سره، دا الګوریتمونه لا تر اوسه د بشپړ څخه ډیر دي.

شکل 5.7: د پروتین پوښ. د انځورخبره د ډاکټر کجراج / ویډیو کامرون.

شکل 5.7: د پروتین پوښ. د انځور "داکترخبرګر" / Wikimedia Commons .

ډیوډ بیکر او د واشنګتن پوهنتون کې د هغه څیړنیز ډله د ساینس پوهانو ټولنې وه چې د پروټین ډیزاین لپاره کمپیوټري تګلارې جوړې کړې. په یوه پروژه کې، بیکر او همکارانو یو داسې سیستم رامینځ ته کړ چې داوطلب رضاکاران د خپلو پروټوینونو د تخفیف کولو لپاره د دوی کمپیوټرونو لپاره غیر منظم وخت مرسته کوي. په بدل کې، رضاکاران کولی شي یو اسیرینورورور وګوري چې د پروټین ډیزاین چې په خپل کمپیوټر کې پیښیږي. د دغو داوطلبانو ډیری بیکر او همکارانو ته لیکلي چې دوی فکر کوي چې دوی د کمپیوټر په فعالیت کې ښه والی کیدی شي که دوی په محاسبه کې ښکیل شي. او په همدې توګه فولډیټ (Hand 2010) پیل شو.

فولډیټ د پروټین فولډ پروسې په هغه لوبه کې بدلوي چې د هر چا لخوا لوبول کیدی شي. د لوبغاړی د نظریې څخه، فولډیت ښکاري ښکاري (5.8 شکل). لوبغاړي د پروتین ساختماني درې اړخیز ټنګل سره وړاندې کیږي او کولی شي عملیاتونه "ټیکاک"، "Wiggle،" "بیا رغونه" - خپل شکل بدل کړي. د دې عملیاتو ترسره کولو له الرې لوبغاړو د پروټین بڼه بدلوي، چې په پایله کې یې د دوی نمرې زیاتې کوي یا کموي. په انتقالي توګه، سکټور د اوسني ترتیباتو د انرژۍ کچې پر بنسټ حساب شوی دی. د کم انرژی ترتیبات په لوړه کچه پایله لري. په بل عبارت، دا سکټور د لوبغاړو الرښوونه کوي لکه څنګه چې دوی د ټیټ انرژۍ ترتیبونو لټون کوي. دا لوبه یوازې د ممکنه ده ځکه چې د نیک فلکس پریزنټ پروټین ډیزاین کې د فلم درجه بندي اټکل کوي لکه یو داسې وضعیت دی چې د تولید له پرتله حل کولو لپاره اسانه ده.

شکل 5.8: د فولډیت لپاره د غږ سکرین. د http://www.fold.it څخه د اجازې بیاکتنه.

شکل 5.8: د فولډیت لپاره د غږ سکرین. د http://www.fold.it څخه د اجازې بیاکتنه.

د فولټ ښکلي ډیزاین هغه لوبغاړي چې د بایو کیمیا لږ رسمي پوهه لري د وړو الګوریتمونو سره سیالي کوي چې د متخصصینو لخوا ډیزاین شوي. پداسې حال کې چې ډیری لوبغاړي په دې برخه کې په ځانګړي ډول ښه ندي، د لوبغاړو لږ شمیر لوبغاړي او کوچني ټیمونه شتون لري چې غیر معمولي دي. په حقیقت کې، د فولډ لوبغاړو او غیر دولتي ارګوریممونو ترمنځ د سر سر سیالیو کې، لوبغاړو د 10 پروتینونو څخه 5 څخه غوره حل الرې جوړې کړې (Cooper et al. 2010) .

Foldit او د Netflix جایزه په ډیرو الرو کې توپیر لري، مګر دوی دواړه د حل لپاره د پرانیستې غوښتنې غوښتنه کوي چې د تولید په پرتله د چک کولو لپاره اسانه دي. اوس، موږ به ورته جوړښت په بل بل خورا بیالبیلو ترتیباتو کې وګورو: د پیټری قانون. د پرانیستې کال د ستونځې دا وروستی بیلګه ښیي چې دا تګلاره هم په داسې ترتیبونو کې کارول کیدی شي چې په واضح ډول د مقدار وړ کولو وړ نه وي.