5.3.2 Foldit

ಇದು ಮೋಜು ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸಲು ತಜ್ಞರು ಅಲ್ಲದ ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಏಕೆಂದರೆ Foldit ಒಂದು ಸುಂದರ ಮುಕ್ತ ಕರೆಯಾಗಿದೆ.

ನೆಟ್ಫ್ಲಿಕ್ಸ್ ಪ್ರಶಸ್ತಿ ಎಬ್ಬಿಸುವ ಮತ್ತು ಸ್ಪಷ್ಟ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ಮುಕ್ತ ಕರೆ ಯೋಜನೆಗಳು ಸಂಪೂರ್ಣ ಶ್ರೇಣಿಯ ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ ಇಲ್ಲ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ನೆಟ್ಫ್ಲಿಕ್ಸ್ ಪ್ರಶಸ್ತಿ ಗಂಭೀರ ಭಾಗವಹಿಸುವವರು ಅತ್ಯಂತ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಯಂತ್ರ ಕಲಿಕೆ ತರಬೇತಿ ಮುಂದುವರೆಯಲಿಲ್ಲ. ಆದರೆ, ಮುಕ್ತ ಕರೆ ಯೋಜನೆಗಳು ಯಾವುದೇ ಔಪಚಾರಿಕ ತರಬೇತಿ ಹೊಂದಿರುವ Foldit, ಒಂದು ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಆಟದ ಉಲ್ಲೇಖಿತವಾಗಿದ್ದು, ಭಾಗಿಗಳ ಒಳಗೊಂಡಿರಬಹುದು.

ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಒಂದು ಸರಣಿ ಅದರ ಆಕಾರ ಪಡೆದಿರುತ್ತದೆ ಮೂಲಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆ. ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಒಂದು ಉತ್ತಮ ಗ್ರಹಿಕೆಯನ್ನು, ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆಯೆಂದು ಔಷಧವನ್ನಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಆಕಾರಗಳನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ವಿನ್ಯಾಸ ಎಂದು. ಸ್ವಲ್ಪ ಸರಳಗೊಳಿಸಿ, ಪ್ರೊಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಕನಿಷ್ಠ ಶಕ್ತಿ ಸಂರಚನಾ, ವಿವಿಧ ತಳ್ಳುತ್ತದೆ ಸಮತೋಲನಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ (ಚಿತ್ರ 5.7) ಒಳಗೆ ಸೆಳೆಯುತ್ತದೆ ಒಂದು ಸಂರಚನಾ ಸರಿಸಲು ಒಲವು. ಆದ್ದರಿಂದ, ಸಂಶೋಧಕರು ಇದು ಒಂದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪದರ ಕಾಣಿಸುತ್ತದೆ ಆಕಾರ ಊಹಿಸಲು ಬಯಸಿದರೆ, ಪರಿಹಾರ ಸರಳ ಶಬ್ದಗಳನ್ನು: ಕೇವಲ, ಎಲ್ಲಾ ಸಾಧ್ಯ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ಪ್ರಯತ್ನಿಸಿ ತಮ್ಮ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ಲೆಕ್ಕ, ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕನಿಷ್ಠ ಶಕ್ತಿ ಸಂರಚನಾ ಪಟ್ಟು ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸುತ್ತಾರೆ. ದುರದೃಷ್ಟವಶಾತ್, ಎಲ್ಲಾ ಸಾಧ್ಯ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುತ್ತಿರುವ ಒಳಗೊಂಡ ಈ ವಿವೇಚನಾರಹಿತ ಶಕ್ತಿ ವಿಧಾನ ಶತಕೋಟಿ ಮತ್ತು ಸಂಭಾವ್ಯ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ಶತಕೋಟಿ ಇರುವುದರಿಂದ ಗಣನೆಗೆ ಅಸಾಧ್ಯ. ಸಹ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಅತ್ಯಂತ ಪ್ರಬಲ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ಗಳಿಂದ ಮತ್ತು ನಿರೀಕ್ಷಿತ ಭವಿಷ್ಯದ ವಿವೇಚನಾರಹಿತ ಶಕ್ತಿ ಕೇವಲ ಕೆಲಸಕ್ಕೆ ಹೋಗುತ್ತಿಲ್ಲ ಇದೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಕನಿಷ್ಠ ಶಕ್ತಿ ಸಂರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಹುಡುಕಲು ಅನೇಕ ಬುದ್ಧಿವಂತ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಆದರೆ, ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಮತ್ತು ಗಣಿತಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ಪ್ರಯತ್ನದಿಂದ ಬೃಹತ್ ಪ್ರಮಾಣದ ಹೊರತಾಗಿಯೂ, ಈ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು ಇನ್ನೂ ಪರಿಪೂರ್ಣತೆಯು.

ಚಿತ್ರ 5.7: ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್. ಚಿತ್ರ ದಾಖಲಿಸಿದವರು ಮತ್ತು DrKjaergaard ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಡೊಮೇನ್ ಇರಿಸಲಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಮೂಲ: ವಿಕಿಮೀಡಿಯ ಕಾಮನ್ಸ್.

ಚಿತ್ರ 5.7: ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್. ಚಿತ್ರ ದಾಖಲಿಸಿದವರು ಮತ್ತು "DrKjaergaard" ಸಾರ್ವಜನಿಕ ಡೊಮೇನ್ ಇರಿಸಲಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಮೂಲ: ವಿಕಿಮೀಡಿಯ ಕಣಜದಲ್ಲಿ .

ಡೇವಿಡ್ ಬೇಕರ್ ಮತ್ತು ವಾಷಿಂಗ್ಟನ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯ ತನ್ನ ಸಂಶೋಧನೆ ಗುಂಪು ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಉತ್ತಮ ಕಂಪ್ಯೂಟರಿನ ಸಾಧನೆಗಳು ಅಭಿವೃದ್ದಿಪಡಿಸುತ್ತಿದೆ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳ ಸಮುದಾಯದ ಭಾಗವಾಗಿದ್ದರು. ತಮ್ಮ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು ದೂರ cranking ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ನಡೆಯುತ್ತಿದೆಯೆಂದು ಟ್ರ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಲು, ಬೇಕರ್ ಮತ್ತು ಅವನ ಗುಂಪು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಅವರ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳ ಪ್ರಗತಿ ರೂಪದ ಒಂದು ಸ್ಕ್ರೀನ್ ರಕ್ಷಕ ವೀಕ್ಷಿಸುತ್ತಿದ್ದೆ. ಈ ದೃಶ್ಯೀಕರಣಗಳನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸುವ, ಬೇಕರ್ ಮಾನವರು ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಸಹಾಯ ಸಾಧ್ಯ ಎಂದು ಆಶ್ಚರ್ಯ ಆರಂಭಿಸಿದರು, ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ Foldit, ಒಂದು ಸೃಜನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಸುಂದರ ಮುಕ್ತ ಕರೆ ಆರಂಭಿಸಿದರು (Hand 2010) .

Foldit ಎಂದು ಬೇರಾರೂ ಆಡುವ ಒಂದು ಆಟವಾಗಿದೆ ಒಳಗೆ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆ ತಿರುಗುತ್ತದೆ. ಆಟಗಾರ ದೃಷ್ಟಿಕೋನದಿಂದ, Foldit ಒಂದು ಒಗಟು (ಚಿತ್ರ 5.8) ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಆಟಗಾರರು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯ ಒಂದು ಮೂರು ಆಯಾಮದ ಸಿಕ್ಕು ನೀಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು operations- ಮಾಡಬಹುದು "ತಿರುಚಬಹುದು", "ಹುಳು", "ಪುನರ್" -that ಅದರ ಆಕಾರವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಬಹುದು ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಕಾರ್ಯಾಚರಣೆ ನಿರ್ವಹಿಸುವ ಮೂಲಕ ಆಟಗಾರರು ಪ್ರತಿಯಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಅವರ ಸ್ಕೋರ್ ಕಡಿಮೆಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಕಾರವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಬಹುದು. ವಿಮರ್ಶಾತ್ಮಕವಾಗಿ, ಸ್ಕೋರ್ ಪ್ರಸ್ತುತ ಸಂರಚನಾ ಶಕ್ತಿ ಮಟ್ಟದ ಆಧರಿಸಿ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ; ಕಡಿಮೆ ಶಕ್ತಿ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿನ ಅಂಕಗಳನ್ನು ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಅರ್ಥಾತ್, ಸ್ಕೋರ್ ಕಡಿಮೆ ಶಕ್ತಿ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ಹುಡುಕಲು ಆಟಗಾರರು ಮಾರ್ಗದರ್ಶನ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಏಕೆಂದರೆ- ಕೇವಲ ನೆಟ್ಫ್ಲಿಕ್ಸ್ ಪ್ರಶಸ್ತಿ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಚಿತ್ರದ ರೇಟಿಂಗ್ ಊಹಿಸಲು ನಂತಹ ಸಹ ಅವರನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸಲು ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಹಾರಗಳನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ಸುಲಭ ಅಲ್ಲಿ ಒಂದು ಸನ್ನಿವೇಶ ಈ ಆಟವನ್ನು ಮಾತ್ರ ಸಾಧ್ಯ.

ಚಿತ್ರ 5.8: ಗೇಮ್ Foldit ಸ್ಕ್ರೀನ್.

ಚಿತ್ರ 5.8: ಗೇಮ್ Foldit ಸ್ಕ್ರೀನ್.

Foldit ಸೊಗಸಾದ ವಿನ್ಯಾಸ ತಜ್ಞರು ವಿನ್ಯಾಸ ಉತ್ತಮ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳನ್ನು ಸ್ಪರ್ಧಿಸಲು ಜೀವರಸಾಯನ ಕಡಿಮೆ ಔಪಚಾರಿಕ ಜ್ಞಾನ ಆಟಗಾರರು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಟಗಾರರು ಕೆಲಸವನ್ನು ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಉತ್ತಮ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ, ಕೆಲವು ಆಟಗಾರರು ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ತಂಡಗಳು ಆಟಗಾರರ ಅಸಾಧಾರಣ ಯಾರು ಇವೆ. ವಾಸ್ತವವಾಗಿ, 10 ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೊಟೀನ್ಗಳ ರಚನೆಯ ಮುನ್ನುಡಿ ಹೇಳಲು ಒಂದು ತಲೆ ಗೆ ತಲೆ ಸ್ಪರ್ಧೆಯಲ್ಲಿ, Foldit ಆಟಗಾರರು ರಾಜ್ಯದ ಯಾ ಕಲೆ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು ಐದು ಬಾರಿ ಸೋಲಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು (Cooper et al. 2010) .

Foldit ಮತ್ತು ನೆಟ್ಫ್ಲಿಕ್ಸ್ ಬಹುಮಾನ ಅನೇಕ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಇಬ್ಬರೂ ಸೃಷ್ಟಿಸಲು ಹೆಚ್ಚು ಚೆಕ್ ಸುಲಭ ಎಂದು ಪರಿಹಾರಗಳನ್ನು ಮುಕ್ತ ಕರೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಪೇಟೆಂಟ್ ಕಾನೂನಿನ: ಈಗ, ನಾವು ಮತ್ತೊಂದು ವಿಭಿನ್ನ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ರಚನೆಯ ನೋಡುತ್ತಾರೆ. ತೆರೆದ ಕರೆ ಸಮಸ್ಯೆ ಈ ಅಂತಿಮ ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಅವರು ನಿಸ್ಸಂಶಯವಾಗಿ ಪರಿಮಾಣ ಒಳಪಡುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.