5.3.2 Foldit
Foldit yra gražus atviras kvietimas, nes ji leidžia ne specialistai galėtų dalyvauti būdu, kad yra smagu.
Netflix premija, o žadinantis ir aiškus, nėra iliustruoti pilną Atviras kvietimas projektams. Pavyzdžiui, Netflix premijos dauguma rimtų dalyvių turėjo ilgametę mokymo statistikos ir mašina mokymo. Bet, atvira skambučių projektai taip pat gali apimti dalyvius, kurie neturi formalaus mokymo, kaip buvo iliustruoti Foldit, baltymų lankstymo žaidimą.
Baltymų lankstymo yra procesas, per kurią iš amino rūgščių grandinės sustabdo nuo jo formos. Geriau suprasti šio proceso, biologai galėjo projektuoti baltymus su konkrečių formų, kurios gali būti naudojamos kaip vaistas. Supaprastinti gana nemažai, baltymai linkę persikelti į savo žemiausią energijos konfigūraciją, konfigūracijos, kad būtų subalansuoti įvairias stumia ir traukia per baltymų (5,7 pav.) Taigi, jei tyrėjas nori prognozuoti kokios formos, į kurią baltymas bus sulankstyti, sprendimas skamba paprasta: tiesiog išbandyti visas įmanomas konfigūracijas, apskaičiuoti savo jėgas, ir prognozuoja, kad baltymas bus sulankstyti į žemiausią energijos konfigūraciją. Deja, šis brutalia jėga požiūris, kuris apima bando visas įmanomas konfigūracijas yra skaičiavimais neįmanoma, nes yra milijardus ir milijardus potencialių konfigūracijų. Net galingiausių kompiuterių šiandien-ir artimiausioje ateityje, brutalia jėga yra tik nesiruošia dirbti. Todėl biologai sukūrė daug protingas algoritmai efektyviai ieškoti žemiausios energijos konfigūraciją. Tačiau, nepaisant didelių kiekių mokslo ir skaičiavimo pastangų, šie algoritmai yra dar toli nuo tobulybės.
5.7 pav baltymų lankstymo. Paveikslėlis sukurtas ir pateiktas į visuomenės sritis pagal "DrKjaergaard". Šaltinis: Vikipedija .
Davidas Bakeris ir jo tyrimų grupė Vašingtono universiteto buvo dalis dirbančių mokslininkų kurti geresnius skaičiavimo metodus baltymų lankstymo bendruomenei. Siekiant stebėti, kas vyksta, o jų algoritmai buvo prisukamas toli, Bakeris ir jo grupė būtų kartais žiūrėti ekrano užsklandą, kad vizualizuoti savo algoritmus pažangą. Nors žiūrėti šiuos vizualizacijas, Bakeris pradėjo abejoti, ar tai būtų įmanoma žmogui padėti šiame procese, ir taip prasidėjo Foldit, kūrybingą ir gražus atvirą kvietimą (Hand 2010) .
Foldit paverčia baltymų lankstymo procesą į žaidimą, kuris gali būti žaidžiamas bet kas. Nuo grotuvas perspektyvos, Foldit atrodo, kad Puzzle (5.8 pav.) Žaidėjai pateikti su trimatis raizginys baltymų struktūrą ir gali atlikti operations- "įgnybti", "krutėti", "reBuild" -Tai keisti savo formą. Atliekant šias operacijas žaidėjai pakeisti baltymų formos, kuris savo ruožtu didina arba mažina jų rezultatą. Kritiškai, rezultatas yra apskaičiuotas remiantis energijos lygį dabartinę konfigūraciją; mažesnės energijos konfigūracijos padidėti balai. Kitaip tariant, rezultatas padeda vadovauti žaidėjai, kaip jie ieško mažai energijos konfigūracijų. Šis žaidimas yra įmanoma tik todėl, kad-kaip prognozuoti filmų reitingus Netflix premijos baltymų lankstymo pat situacija, kai ji yra lengviau patikrinti sprendimus nei kurti juos.
5.8 pav Žaidimo ekranas Foldit.
Foldit anketa elegantiškas dizainas leidžia leistuvai su mažai formalias žinias, biochemijos konkuruoti su geriausiais algoritmų, skirtų ekspertai. Nors dauguma žaidėjų yra ne itin gerai užduoties, yra keletas žaidėjų ir mažų komandos žaidėjų, kurie išskirtinė. Tiesą sakant, į galvą į galvą konkurencijos prognozuoja 10 specifinių baltymų struktūrą, Foldit žaidėjai galėjo įveikti state-of-the-art baltymų lankstymo algoritmo penkis kartus (Cooper et al. 2010) .
Foldit ir "Netflix" prizas skiriasi daugeliu atžvilgių, tačiau jie abu susiję viešus kvietimus teikti sprendimus, kurie yra lengviau patikrinti, nei kurti. Dabar mes matome tą pačią struktūrą dar viena labai skirtingos nustatymas: patentų teisė. Tai galutinis pavyzdys kuris vykdomas pagal atviro problemos rodo, kad jie taip pat gali būti naudojami parametrus, kurie yra ne akivaizdžiai gali būti taikoma kiekybinio.
