5.3.2 Foldit

Foldit lîstikek pêvajoyek proteîn-ê ye ku nikarin ne-pisporan bi awayek kêfxweş in beşdar bibin.

Xelata Netflix, di dema ku veguhestin û zelal e, nabe ku tevahiya projeyên vekirî yên vekirî vekin. Ji bo nimûne, di xelata Netflix de piraniya beşdarên girîng ên salan di perwerdehiyê û fêrbûna makîneyê de perwerdehî bûn. Lê, projeyên vekirî yên tevlêbûna tevlî beşdarî beşdarî beşdarî perwerdeya fermî ne, wekî ku ji hêla Foldit ve hate diyarkirin, lîstikek proteîn-parçeyê.

Peldanka Protein ev pêvajoyê ye ku kîjan zincîla amino acîdê wê bixwe dike. Bi fêmkirina vê pêvajoyê, biyolojvan dikarin protein bi taybetmendiyên taybet ên ku dermanan bikar anîn çêbikin. Pêvek hêsan a bitik, protein ji bo veguherîna herî kêm-enerjiyê veguherînin, veguherînek ku balêk cuda cuda dike û di nav proteîn (5.7) de vekişîne. Ji ber vê yekê, heger, lêkolîner dixwaze ku ew çîroka ku protein dê bibe, çareseriyên hêsan hêsan e: tenê hewldanên hemî gengaz biceribînin, hêza wan dike, û pêşniyar dike ku protein dê di binhevkirina enerjiyê de herî kêm kêm bike. Mixabin, hemû hewceyên muhtemelî hewldan hewldar e ku bêyî mîhengên mîlyon û mîlyonên mîhengên potansiyonê hene. Her weha bi komputerên herî hêzdar ên îro îro-û di hêza pêşerojê de-pêşerojê ne tenê ne ku kar bikin. Ji ber vê yekê, biyolojvanên algorîtmê gelek pispor hatine çêkirin ku ji bo veguhertina enerjiyê ya herî kêm bandor bibînin. Lê belê tevî hewceyên pir hewceyên zanistî û teknolojî, ev algorithm hê jî ji temamî ne.

Figure 5.7: Peldanka Protein. Wêne li darizandinê ya DrKjaergaard / Wikimedia Commons.

Figure 5.7: Peldanka Protein. Wêne li darizandinê ya "DrKjaergaard" / Wikimedia Commons .

Dawid Baker û komîteya lêkolînê ya li Zanîngeha Waşîngton beşdarî civakê zanistên xebitîn dixebitin ku nêzîkên damezirandinê yên li ser pêvajoya dabeşkirinê çêbikin. Di projeyeke yek de, Beker û hevkarên pergala ku bi dilxwazên ku dilxwazên xwe yên li ser komputerên xwe yên drav didin alîkariya diravkirina pêdiviya protein re alîkariyê diaşirand. Di vegera de, dilxwazên dilxwaz dikarin li ser vîdyoyên ku li ser komputerê ya ku li ser komputerê tê çêkirin nîşan dide. Hin ji van volunteerên ji Baker û hevpeymanan re got ku ew fikrên ku ew dikarin li ser karê komputerê çêtir dibe ku li ser hesabê tevlê bibin. Û vî rengî Foldit (Hand 2010) dest pê kir.

Foldit pêvajoya pelê ya protein veguherîne lîstikek ku ji aliyê her kesî ve tê lîstin. Ji ber perspektora lîstikvan, Foldît xuya ye (pirtûk 5.8). Playvan bi tengleya protein a sê-dimîn têne pêşniyarkirin û dikarin çalakiyên xwe bidin - "tweak," "wiggle," "rebuild". Bi tevgera operasyonên lîstikvanên şêweya proteîn veguherînin, ku di encama wan de heqê wan hebe. Rêjeya, hejmar bi asta enerjiyê ya heyî veguherîn tê hesibandin; Guhertina enerjiya kêm-ê di encamên bilind de. Di heman demê de, hejmara lîstikvanan rêber dike ku ew ji bo veguhertina enerjiyê kêm dikin lêgerîn. Ev lîstik tenê dikare ji ber ku-tenê wekî fîlmên pêşniyazkirina pêşniyarên Netflix-protein-protein-pêşveçûn jî ew jî rewş e ku rewşek hêsantir dike ku ji wan re hilber bikin.

Figure 5.8: Zebûrkirina lîstika ji bo Foldit. Ji hêla http://www.fold.it ve hatî hilberandin.

Figure 5.8: Zebûrkirina lîstika ji bo Foldit. Ji hêla http://www.fold.it ve hatî hilberandin.

Pêşniyarên firoit ên fîlmên ku bi zanistina biochemistry hindik fermî dibe ku ji bo pisporên pisporên algorithm çêkiriye pêşbaziyê bikin. Dema ku piraniya lîstikvanan bi taybetî di karê xwe de baş ne hene, hejmarek hinek lîstikvan û tîmên piçûk yên ku nexwendin in. Bi rastî, di pêşbaziyê de di navbera di navbera Foldit û algorîtên dewleta huner de, lîstikvanên 5 ji 5 protein (Cooper et al. 2010) çêtirîn çareser kirin.

Foldit û Netflix xelata di gelek awayan de cûda ye, lê herdu jî ji bo çareseriyên ku hêsantir ji hêla çêtirîn çêtirîn, bangên vekirî hene. Niha, em ê di heman rengî deynek li ser damezirandineke din gelek cihan: dê qanûna patent. Ev nimûne ya pirsgirêkê ya pirsgirêkê ya vekirî dide nîşandan ku ev nêzîk dikare di nav sazûbarên ku di navnîşana nirxandinê de ne diyar in.