5.3.2 Foldit

Foldit занг зебо кушода аст, зеро он ғайридавлатӣ коршиносон имкон барои иштирок дар роҳ аст, ки масхара.

Ҷоизаи Netflix, дар ҳоле ки evocative ва равшан кунад, маҷмӯи пурраи лоиҳаҳои занги кушода тасвир нест. Барои мисол, дар ҷоизаи Netflix аксарияти иштирокчиёни ҷиддӣ сол омӯзиш дар омор ва омӯзиши мошини дошт. Аммо, лоиҳаҳои занги кушода низ метавонад иштирокчиён, ки маълумоти расмӣ надорад, чунон ки аз тарафи Foldit, бозӣ сафеда туморе тасвир шуд, дар бар мегирад.

туморе сафеда раванди ки тавассути он занҷири кислотањои аминокислотаҳо мегирад оид ба шакли он аст. Бо дарки беҳтари ин раванд, биологияву метавонад сафедањо бо профилҳои хос, ки метавон ҳамчун тиб истифода бурда тарҳрезӣ. Содда хеле каме, сафедаҳо майл ба ҳаракат ба пасттарин танзимоти энергетикии худро, як танзимот, ки мувозинатро тела гуногун ва pulls дар дохили сафеда (расми 5.7). Пас, агар як пажӯҳишгари мехоҳад барои пешгӯии чӣ шакли ба он сафедаи баробар хоҳад кард, ба ҳалли садо оддӣ: танҳо кӯшиш ҳамаи пайкарбандии имконпазир, ҳисоб қувваташро барои онҳо ва ҳадс мезананд, ки сафеда хоҳад, ба пасттарин конфигуратсияи энергетикӣ сурат бармегардонанд. Мутаассифона, ин равиши қувваи безабон, ки бар мегирад, кӯшиши ҳамаи конфигуратсияҳое имконпазир computationally имконнопазир аст, зеро миллиардҳо ва миллиардҳо конфигуратсияҳое эҳтимолӣ вуҷуд дорад. Ҳатто бо компютерҳои пуриқтидор ҳама дастрас имрӯз ва дар амал пешбинигардидаи оянда безабон аст, танҳо рафтан ба кор. Аз ин рӯ, биологияву бисёр алгоритмҳои доно таҳия кардаанд, ки ба самаранок барои пасттарин конфигуратсияи энергетика ҷустуҷӯ кунед. Вале, сарфи назар аз миқдори азими кӯшишҳои илмӣ ва компютеризатсия, ин алгоритме, ҳанӯз аз комилият хело дур.

Расми 5.7: протеини туморе. Симои офарида шудааст ва ба домени ҷамъиятӣ аз ҷониби DrKjaergaard ниҳод. Манбаъ: Wikimedia Commons.

Расми 5.7: протеини туморе. Симои офарида шудааст ва ба домени ҷамъиятӣ аз ҷониби «DrKjaergaard» љойгир карда шавад. Манбаъ: Wikimedia Commons .

Дэвид Бейкер ва гурӯҳи илмии ў дар Донишгоҳи Вашингтон як қисми ҷомеа олимон корї оид ба тањияи усулњои компютеризатсия беҳтар ба туморе сафедаи буданд. Бо мақсади пайгирӣ чӣ рӯй медод дар ҳоле, алгоритмҳои худ дур cranking шуданд, Baker ва гурӯҳи ӯ баъзан як экран-ноҷи, ки дар рафти онҳо алгоритмҳои visualized бедор. Дар ҳоле ки тамошои ин visualizations, Baker сар ба фикр, ки оё он имконпазир бошад, барои одамон ба ёрӣ дар раванди, ва ба ин васила оғоз Foldit, занги эҷодӣ ва зебо кушода (Hand 2010) .

Foldit рӯй раванди туморе сафеда ба бозӣ, ки мумкин аст аз ҷониби касе бозид. Аз нуқтаи назари плеери, Foldit пайдо шавад муаммо (расми 5.8). Бозингарони бо як tangle се-ченака сохтори сафеда пешниҳод ва иҷро карда наметавонад operations- «tweak», «ҳаракат кардан», «аз нав», яъне шакли худро тағйир диҳед. Бо иҷрои ин амалиёт бозингарони тағйир додани шакли протеин, ки дар навбати худ зиёд ё ба холњои коҳиш меёбад. Танқидӣ, дар холи дар асоси сатҳи энергетикӣ аз танзимати ҷорӣ ҳисоб карда мешавад; конфигуратсияҳое поёнии энергетикии холҳои баланд оварда мерасонад. Ба ибораи дигар, ба холи кӯмак ҳидоят бозингарони онҳо барои конфигуратсияҳое-энергетикӣ паст ҷустуҷӯ. Ин бозӣ аст, танҳо имконпазир, зеро-мисли пешгӯӣ рейтинги филм дар Netflix туморе Ҷоизаи-сафеда низ вазъияте, ки дар он осонтар ба тафтиш ҳалли аз тавлиди онҳо аст.

Расми 5.8: бозиҳо экран барои Foldit.

Расми 5.8: бозиҳо экран барои Foldit.

тарҳи шево Foldit ба бозингарони бо дониши расмии андаке аз биохимия имкон ба рақобат бо беҳтарин алгоритмҳои тарҳрезӣ аз ҷониби коршиносони. Дар ҳоле ки аксарияти бозингарони дар вазифаи махсусан хуб нест, як чанд бозигарони ва дастаҳои хурд бозигарони, ки истисної ҳастанд. Дар асл, дар озмуни сардори-ба-сар барои пешгӯии сохтори 10 сафедањо мушаххас, бозингарон Foldit қодир зада давлатии-аз-ба-санъати алгоритмҳои туморе сафедаи панҷ маротиба буданд (Cooper et al. 2010) .

Foldit ва мукофот Netflix аз бисёр ҷиҳатҳо фарқ доранд, вале онҳо ҳам дар бар мегирад зангҳои кушода барои ҳалли ки осонтар ба тафтиш аз тавлиди. Қонуни патент: Акнун, мо ба сохтори ҳамин боз хеле гуногун ғуруби дид. Ин намунаи ниҳоии масъалаи занги кушода нишон медиҳад, ки онҳо низ метавонанд дар танзимоти, ки баръало ба amenable quantification нест, истифода бурда шавад.