5.3.2 Foldit

Foldit ላልሆኑ ባለሙያዎች በሚያዝናኑበት መንገድ እንዲሳተፉ የሚያግድ ፕሮቲን-ማጠቢያ ጨዋታ ነው.

የ Netflix ሽልማት, ተምሳሌታዊ እና ግልፅ ሆኖ, ሙሉውን የጥሪ ፕሮጀክቶች ሙሉ ዝርዝር አያሳይም. ለምሳሌ, በ Netflix ሽልማት አብዛኛዎቹ ተሳታፊዎች በስታቲስቲክስ እና በማሽን ለተለማመዱ የዓመታት ሥልጠና ነበራቸው. ነገር ግን በፊልድ ፕሮፌሰር ማጫወቻ ጨዋታ እንደታየው መደበኛ የሙያ ሥልጠና የሌላቸው ተሳታፊዎች ጥሪ ማድረግ ይችላሉ.

ፕሮቲን መጋለጥ ማለት ሰንሰለቱን የሚወስዱ የአሚኖ አሲዶች ሰንሰለት ነው. ስለዚህ ሂደቱ በተሻለ መንገድ ባዮሎጂስቶች እንደ መድሃኒት ሊውሉ በሚችሉ በተወሰኑ ቅርጾች ላይ ፕሮቲኖችን ሊሠሩ ይችላሉ. ፕሮቲን (ፕሮቴክቶች) ትንሽ ወደ ቀላልነት በማቅለጥ ወደ ዝቅተኛ የኢነርጂ ውቅረታቸው ይንቀሳቀሳሉ. የተለያዩ ውህዶች (ሚዛን) እና በፕሮቲን ውስጥ የሚስቡትን ውህዶች (ሚዛን 5) ይይዛሉ. ስለዚህ, ተመራማሪው ፕሮቲን የሚያርገበውን ቅርጽ ለመተንበይ ከፈለጉ, መፍትሔው ቀላል ነው, ሁሉንም ሊሆኑ የሚችሉትን መዋቅሮች ይሞክሩ, ጉልበታቸውን ያስሉ እና ፕሮቲን ወደ ዝቅተኛ የኢነርጂ ውህደት እንደሚይዝ ይተነብያል. በሚያሳዝን ሁኔታ, ሁሉንም ሊሆኑ የሚችሉ ውቅሮችን መሞከር በሂሳብ ስራ ሊሆኑ አይችሉም ምክንያቱም ሊሊዮኖች እና ቢሊዮኖች ሊሆኑ የሚችሉ ልኬቶች አሉ. በጣም ኃይለኛ በሆኑት ኮምፒዩተሮችም እንኳ ሳይቀር ወደፊት እና በሚቀጥለው ትውልድ ውስጥ - ጥርት ሃይል ሥራ መሥራት ብቻ አይደለም. ስለዚህ, ባዮሎጂስቶች ዝቅተኛውን የኢነርጂ ውህደትን በብቃት ለመፈለግ በርካታ ብልህነት ያላቸው አልጎሪዝሞች አዳብረዋል. ነገር ግን, እጅግ በጣም ብዙ ሳይንሳዊ እና አስቂኝ ጥረትዎች ቢኖሩም, እነዚህ አል-ክሪፈሮች አሁንም ከአለባቸው እጅግ የላቁ ናቸው.

ምስል 5.7 ፕሮቲን ማጠፍ. በ "DrKjaergaard" / Wikimedia Commons . የሚያያዙት ገጾች ስዕ.

ዴቪድ ቤከር እና የምርምር ቡድኑ በዋሽንግተን ዩኒቨርሲቲ ውስጥ የፕሮቲን ሽፋንን የመቀነስ ዘዴዎችን ለመፍጠር የሚሰሩ ሳይንቲስቶች ማህበረሰብ አካል ነበሩ. ቤኪከር እና ባልደረቦች በአንድ ፕሮጀክት ውስጥ የፕሮቲን ፕሮቲን ለማስመሰል የፈቃደኛ ሠራተኞችን ጊዜያቸውን በ "ኮምፒውተሮቻቸው" ላይ እንዲሰጡ የፈቀደበት ስርዓት አዳብረዋል. በምላሹም ፈቃደኛ ሠራተኞቹ በኮምፒዩተርዎ ላይ የሚከሰተውን ፕሮቲን በፕሮቲን ውስጥ እያሳዩ የሚታይበትን ማያ ገጽ ማየት ይችላሉ. ብዙዎቹ ፈቃደኛ ሠራተኞች ለቤከር እና ለሥራ ባልደረቦች በሒሳብ ስሌት ውስጥ ሊሳተፉ ከፈለጉ የኮምፒዩተር አፈፃፀም ላይ ማሻሻያ እንዳላቸው ጽፈው ነበር. እንደዚሁም Foldit (Hand 2010) .

Foldit የፕሮቲን ጣጣዎችን በማንም ሰው ሊጫወት በሚችል ጨዋታ ውስጥ ይቀይረዋል. ከአጫዋቹ አንፃር, ፊሎድ እንቆቅልሽ ሆኖ ይታያል (ስእል 5.8). ተጫዋቾች በሦስት እርከን የፕሮቲን አወቃቀር ተጨባጭ እና "ክምችት," "መንቀዝቀፍ," "እንደገና መገንባት" - ቀለም መቀየርን ሊያካሂዱ ይችላሉ. እነዚህን ክንውኖች በማከናወን ተጨዋቾች የፕሮቲኑን ቅርጽ ይቀይራሉ, ይህም በምላሹ ውጤታቸውን ይጨምር ወይም ይቀንሳል. በተጨባጭ, ውጤቱ አሁን ባለው አወቃቀር የኃይል ደረጃ ላይ ተመስርቶ ይሰላል. ዝቅተኛ-የኃይል ውቅሮች ከፍተኛ ውጤቶችን ያስገኛሉ. በሌላ አባባል ውጤቱ ዝቅተኛ የኃይል ለውጦችን ሲፈልጉ ተጫዋቾቹን ለመምራት ይረዳል. ይህ ጨዋታ ሊገኝ የሚችለው ብቻ ስለሆነ በ Netflix ሽልማት-ፕሮቲን ማጠራቀሚያ ውስጥ የፊልም ደረጃዎች እንደሚተነብዩ ሁሉ ከመሰነጣጠር ይልቅ መፍትሔዎችን ለመፈተሽ የቀለለ ሁኔታ ነው.

ምስል 5.8 ለ Foldit የጨዋታ ገጽ. ከ http://www.fold.it በመተግበር የቀረበ.

የፌልዴት የተዋጣለት ንድፍ ተጫዋቾች አነስተኛ የባዮኬሚስትሪ ዕውቀት ያላቸው በባለሙያው የተሰሩ ምርጥ ስልተ ቀመሮችን ለመወዳደር ያስችላቸዋል. አብዛኛዎቹ ተጫዋቾች በተለየ ስራዎች ላይ ባይሆኑም ጥቂት ግለሰቦች እና አነስተኛ ተጫዋቾች ያላቸው ልዩ ተጫዋቾች አሉ. እንዲያውም በ Foldit ተጫዋቾች እና በአስቸኳይ ስልተ ቀመሮቻቸው መካከል በአጠቃላይ ለዋና ዋና ፉክክርዎች ተጫዋቾች ተጫዋቾቹ ለአምስት የፕሮቲኖች (Cooper et al. 2010) 5 ፕሮቲኖች) የተሻለ መፍትሄን ፈጥረዋል (Cooper et al. 2010) .

Foldit እና የ Netflix ሽልማቱ በብዙ መንገዶች የተለያዩ ናቸው, ነገር ግን ሁለቱም ከሚመነጩት ይልቅ ለመፈተሸ ለሚፈጠሩት መፍትሄዎች ክፍት ጥሪዎች ናቸው. አሁን ግን ተመሳሳይ የሆነ አወቃቀር በተለየ በጣም የተለየ መቼት ውስጥ እንመለከተዋለን. ይህ ግልጽ የክወና ችግሩ የዚህ የመጨረሻ ምሳሌ እንደሚያሳየው ይህ አቀራረብ በቁጥጥር / quantification ላይ ግልፅ ባልሆኑት መቼቶች ውስጥ ሊያገለግል ይችላል.