5.3.2 Foldit

Ko te Pouaka he putea pūmua-kapi hei awhina i nga kore-tohunga ki te uru atu ki tetahi huarahi e ngahau ana.

Ko te Priflix Prize, i te mea e ngahau ana, e maama ana, e kore e whakaatu i te katoa o nga kaupapa karanga tuwhera. Hei tauira, i roto i te Netflix Prize te nuinga o nga kaihauturu nui kua maha nga whakangungu i roto i te tatauranga me te ako mīhini. Engari, ka taea hoki e nga kaupapa karanga tuwhera te whakauru i nga kaihauturu kahore nei he whakangungu whakangungu, i whakaatuhia e Foldit, he putea pūmua-putea.

Ko te panuku o te protein ko te tukanga na te waahanga o te waikawa amino i te hanga. Ma te mohio pai ake ki tenei tukanga, ka taea e nga kaiao koiora te waihanga i nga purapura me etahi momo motuhake ka taea te whakamahi hei rongoa. Ko te whakaiti noa i te iti, ko nga paanga e anga ana ki te neke ki to raatau-tohanga kaha, he whirihoranga e pauna ana i nga momo pana me te kukume i roto i te pene (ahua 5.7). Na, mehemea ka hiahia te kairangahau ki te tohu i te ahua ka pupuhihia te potae, kaore te whakautu e ngawari: kia ngana i nga whiriwhiringa katoa, te tautuhi i o raatau kaha, me te tohu ka pupuhihia te potae ki te whirihoranga-iti rawa. Engari, ko te ngana katoa o nga whiriwhiringa kaore e taea, no te mea he miriona me nga miriona o nga whiriwhiringa pea. Ahakoa nga rorohiko kaha rawa atu i tenei ra-kaore ano i te mahi i te kaha o te kaha ki te heke mai. Na reira, kua whakawhanaketia e te hunga koiora etahi ahumahi algorithms ngawari ki te rapu tika mo te whirihoranga o te iti-kaha. Engari, ahakoa te nui o nga mahi rangahau me te mahi, kaore i tino tika enei waitohu.

Whakaahua 5.7: Te pirihanga a Protein. Whakaahua ataahua a DrKjaergaard / Wikimedia Commons.

Whakaahua 5.7: Te pirihanga a Protein. Whakaahua ataahua o "DrKjaergaard" / Wikimedia Commons .

Ko David Baker me tana roopu rangahau i Te Whare Wānanga o Washington he wahi o te hapori o nga kaimori e mahi ana ki te waihanga i nga huarahi whakawhiti ki te panui pūmua. I roto i tetahi kaupapa, i hangaia e Baker me nga hoa mahi he pünaha i whakaaetia ai nga kaiwhiwhi ki te tuku i te wa kaore i runga io raatau rorohiko hei awhina i te whakakotahi i te whakawhitinga pūmua. Hei whakahoki, ka taea e nga kaiwhaiwhai te tirotiro i tetahi matapihi e whakaatu ana i te whakawhitinga potae kei te whakahaere i to rorohiko. Ko etahi o enei kaitohutohu i tuhi ki a Baker me o hoa mahi e ki ana ko nga whakaaro ka taea e ratou te whakapai ake i te mahi a te rorohiko mehemea ka taea e ratou te whakauru atu ki te tatauranga. Na ka timata te Poldit (Hand 2010) .

Ka hurihia e te Kōpaki te tukanga o te whakapokepoke pūmua ki tētahi kēmu e taea e te tangata te takaro. Mai i te tirohanga a te kaitakaro, Ka puta he Pupo (ahua 5.8). Ka whakaatuhia nga kaitakaro ki te hanganga e toru-hanganga o te hanganga pūmua, ka taea te whakahaere i nga mahi- "tweak," "wiggle," "te hanga" -e whakarereketia ana te ahua. Ma te mahi i enei mahi ka whakarerekē te ahua o te pūmua, ka whakanui ake, ka heke iho ranei i to tatau. Ko te tohu, ko te tatauranga ka tohua i runga i te taumata kaha o te whirihoranga o naianei; Ko nga whiriwhiringa iti iho-kaha ka puta i nga taumata teitei ake. I etahi atu kupu, ka awhina te tohu ki te arahi i nga kaitākaro i a ratau e rapu ana i nga whiriwhiringa iti-kaha. Ka taea anake tenei kēmu-no te mea ko te tohu i nga tohu kiriata i te Netflix Prize-protein folding ko te mea hoki he mea māmā ake te tiro i ngā rongoā i te whakaputa i a ratou.

Whakaatu 5.8: Mataata mo te Poari. I whakahokia ma te whakaaetanga mai i http://www.fold.it.

Whakaatu 5.8: Mataata mo te Poari. I whakahokia ma te whakaaetanga mai i http://www.fold.it.

Ko te hoahoa whakairoiro a te Kōpaki e taea ai e nga kaitākaro te iti o te matauranga o te biochemistry ki te whakataetae ki nga waahanga pai rawa i hangaia e nga tohunga. Ahakoa ko te nuinga o nga kaitakaro kaore i te tino pai i te mahi, he torutoru nga kaitono me nga kapa iti o te kaitakaro he tino ataahua. Ina koa, i te whakataetae upoko i waenganui i nga kaitakaro me nga taatau-a-toi-ahumahi, i hangaia e nga kaitakaro he rongoora pai ake mo te 5 o nga 10 pauna (Cooper et al. 2010) .

He rerekē nga putea me nga taonga Netflix i roto i te maha o nga huarahi, engari kei a raua katoa nga karanga tuwhera mo nga rongoā kawari ake te tirotiro atu i te whakaputa. Na, ka kite tatou i te ahua ano i roto i tetahi atu waahanga rereke: ture pateni. Ko tenei tauira whakamutunga o te raru o te karanga tuwhera e whakaatu ana ka taea hoki te whakamahi i tenei huarahi ki nga tautuhinga kaore e tino kitea ana ki te ine.