5.3.2 फोल्ड इट

फोल्ड इट क्योंकि यह एक तरीका है कि मजाक में भाग लेने के लिए सक्षम बनाता है गैर-विशेषज्ञों का एक सुंदर खुला फोन है।

नेटफ्लिक्स पुरस्कार, जबकि विचारोत्तेजक और स्पष्ट है, ओपन कॉल परियोजनाओं की पूरी रेंज का उदाहरण देकर स्पष्ट नहीं है। उदाहरण के लिए, नेटफ्लिक्स पुरस्कार में गंभीर प्रतिभागियों की सबसे सांख्यिकी और मशीन सीखने में प्रशिक्षण के वर्षों के लिए किया था। लेकिन, ओपन कॉल परियोजनाओं को भी प्रतिभागियों जो कोई औपचारिक प्रशिक्षण दिया है, के रूप में फोल्ड इट, एक प्रोटीन तह खेल से यह साफ हो गया था शामिल कर सकते हैं।

प्रोटीन तह प्रक्रिया के माध्यम से जो एमिनो एसिड की एक श्रृंखला अपने आकार पर ले जाता है। इस प्रक्रिया का एक बेहतर समझ के साथ, जीव विशिष्ट आकार है कि दवा के रूप में इस्तेमाल किया जा सकता है के साथ प्रोटीन डिजाइन सकता है। काफी एक सा सरल बनाने, प्रोटीन अपने न्यूनतम ऊर्जा विन्यास, एक विन्यास है कि विभिन्न धक्का संतुलन और प्रोटीन (चित्रा 5.7) के भीतर खींचतान के लिए ले जाने के लिए करते हैं। तो, एक शोधकर्ता भविष्यवाणी करने के लिए क्या आकार में जो एक प्रोटीन गुना होगा चाहता है, समाधान सरल लगता है: बस सभी संभव विन्यास की कोशिश, अपनी ऊर्जा की गणना, और अनुमान है कि प्रोटीन सबसे कम ऊर्जा विन्यास में गुना होगा। दुर्भाग्य से, इस जानवर बल दृष्टिकोण शामिल है कि सभी संभव विन्यास की कोशिश कर computationally असंभव अरबों और संभावित विन्यास के अरबों देखते हैं क्योंकि है। यहां तक ​​कि सबसे शक्तिशाली उपलब्ध कंप्यूटरों के साथ आज और निकट भविष्य-जानवर बल में न सिर्फ काम करने के लिए जा रहा है। इसलिए, जीव कुशलता से सबसे कम ऊर्जा विन्यास के लिए खोज करने के लिए कई चालाक एल्गोरिदम विकसित किया है। लेकिन, वैज्ञानिक और कम्प्यूटेशनल प्रयास का भारी मात्रा में होने के बावजूद, इन एल्गोरिदम अभी भी दूर से परिपूर्ण हैं।

चित्रा 5.7: प्रोटीन तह। छवि बनाई और "DrKjaergaard" द्वारा सार्वजनिक डोमेन में रखा गया था। स्रोत: विकिपीडिया ।

डेविड बेकर और वाशिंगटन विश्वविद्यालय में अपने शोध समूह प्रोटीन तह करने के लिए बेहतर कम्प्यूटेशनल दृष्टिकोण विकसित करने के लिए काम कर रहे वैज्ञानिकों के समुदाय का हिस्सा थे। आदेश को ट्रैक करने के लिए क्या हो रहा था, जबकि उनके एल्गोरिदम दूर cranking थे, बेकर और उनके समूह कभी कभी एक स्क्रीन सेवर अपने एल्गोरिदम की प्रगति की कल्पना की है कि देखना चाहेंगे। इन दृश्यावलोकन देख रहा है, वहीं बेकर आश्चर्य है कि क्या यह मनुष्य की प्रक्रिया में मदद करने के लिए संभव हो जाएगा शुरू किया, और इस तरह फोल्ड इट, एक रचनात्मक और सुंदर ओपन कॉल करना शुरू किया (Hand 2010) ।

फोल्ड इट किसी के द्वारा खेला जा सकता है कि एक खेल में प्रोटीन तह की प्रक्रिया बदल जाता है। खिलाड़ी के दृष्टिकोण से, फोल्ड इट एक पहेली (चित्रा 5.8) प्रतीत होता है। खिलाड़ियों प्रोटीन संरचना का एक तीन आयामी उलझन के साथ प्रस्तुत कर रहे हैं और operations- प्रदर्शन कर सकते हैं "wiggle" "tweak", "पुनर्निर्माण" यानी अपने आकार को बदल। इन आपरेशनों प्रदर्शन करके खिलाड़ियों प्रोटीन का आकार बदलने के लिए, बारी में बढ़ या अपने स्कोर कम हो जाती है। गंभीर, स्कोर मौजूदा विन्यास की ऊर्जा के स्तर के आधार पर गणना की जाती है; कम ऊर्जा विन्यास उच्च अंक में परिणाम। दूसरे शब्दों में, स्कोर के रूप में वे कम ऊर्जा विन्यास के लिए खोज खिलाड़ियों का मार्गदर्शन में मदद करता है। यह खेल केवल संभव है, क्योंकि बस भी एक स्थिति है जहाँ यह उन्हें उत्पन्न से समाधान की जांच करने के लिए आसान है नेटफ्लिक्स पुरस्कार प्रोटीन तह में फिल्म रेटिंग्स की भविष्यवाणी की तरह।

चित्रा 5.8: खेल फोल्ड इट के लिए स्क्रीन।

फोल्ड इट के सुरुचिपूर्ण डिजाइन विशेषज्ञों द्वारा डिजाइन सबसे अच्छा एल्गोरिदम के साथ प्रतिस्पर्धा करने के लिए जैव रसायन के कम औपचारिक ज्ञान के साथ खिलाड़ियों को सक्षम बनाता है। जबकि अधिकांश खिलाड़ियों कार्य पर विशेष रूप से अच्छा नहीं कर रहे हैं, वहाँ कुछ खिलाड़ियों और खिलाड़ियों की छोटी टीमों जो असाधारण रहे हैं। वास्तव में, एक सिर से सिर प्रतियोगिता 10 विशिष्ट प्रोटीन की संरचना की भविष्यवाणी करने के लिए, फोल्ड इट खिलाड़ियों राज्य के अत्याधुनिक प्रोटीन तह एल्गोरिदम पांच बार हरा करने में सक्षम थे (Cooper et al. 2010) ।

फोल्ड इट और Netflix पुरस्कार कई मायनों में अलग हैं, लेकिन वे दोनों समाधान है कि उत्पन्न से जाँच करने के लिए आसान कर रहे हैं के लिए खुला कॉल शामिल है। पेटेंट कानून: अब, हम अभी तक एक बहुत अलग सेटिंग में एक ही संरचना देखेंगे। एक खुला कॉल समस्या के इस अंतिम उदाहरण से पता चलता है कि वे भी सेटिंग्स जाहिर है कि मात्रा का ठहराव के लिए उत्तरदायी नहीं हैं में इस्तेमाल किया जा सकता है।